More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1086 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  65.62 
 
 		 201 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 199 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  55.56 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  41.33 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  28.97 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 192 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>