196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2166 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1249 aa  2281    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  54.93 
 
 		 1291 aa  901    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  54.32 
 
 		 995 aa  287  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  50.73 
 
 		 881 aa  270  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  40.35 
 
 		 989 aa  234  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  54.81 
 
 		 1191 aa  224  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  52.58 
 
 		 1025 aa  224  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  43.6 
 
 		 962 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  54.13 
 
 		 995 aa  214  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  45.78 
 
 		 986 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  50.26 
 
 		 1023 aa  202  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  47.62 
 
 		 986 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  46.35 
 
 		 1020 aa  182  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  45.07 
 
 		 1046 aa  182  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  40.95 
 
 		 1022 aa  180  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  56 
 
 		 1047 aa  174  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  41.96 
 
 		 1058 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  45 
 
 		 1009 aa  170  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  39.9 
 
 		 1030 aa  169  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.36 
 
 		 1029 aa  164  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  41.75 
 
 		 1017 aa  163  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  44.55 
 
 		 1006 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  31.14 
 
 		 1029 aa  162  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.37 
 
 		 1029 aa  161  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.46 
 
 		 1029 aa  161  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  31.07 
 
 		 1029 aa  160  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 1018 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.91 
 
 		 1029 aa  160  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.7 
 
 		 1029 aa  160  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.91 
 
 		 1029 aa  160  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.75 
 
 		 1029 aa  159  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.98 
 
 		 1029 aa  159  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.52 
 
 		 1029 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  29.78 
 
 		 1018 aa  157  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.53 
 
 		 1039 aa  155  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.42 
 
 		 953 aa  155  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  39.49 
 
 		 1013 aa  154  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  40.49 
 
 		 1020 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  31.21 
 
 		 1009 aa  154  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.1 
 
 		 1018 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.91 
 
 		 1018 aa  152  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  41.46 
 
 		 1020 aa  151  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  31.54 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  31.32 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.27 
 
 		 1018 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  38.74 
 
 		 1018 aa  147  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  30.48 
 
 		 1018 aa  144  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  37.29 
 
 		 1081 aa  143  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  35.09 
 
 		 1009 aa  144  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  35.09 
 
 		 1009 aa  144  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  39.66 
 
 		 1049 aa  143  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  37.04 
 
 		 1018 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1018 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1018 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1018 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  37.06 
 
 		 1018 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1018 aa  138  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.66 
 
 		 1038 aa  132  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  42.8 
 
 		 1024 aa  131  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  37.25 
 
 		 1033 aa  130  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  30.09 
 
 		 1114 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  38.42 
 
 		 1046 aa  119  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.4 
 
 		 1108 aa  118  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  28.53 
 
 		 1230 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  37.11 
 
 		 1059 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  41.56 
 
 		 1307 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  43.75 
 
 		 1303 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  48.7 
 
 		 1164 aa  112  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  34.01 
 
 		 1172 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  34.01 
 
 		 1172 aa  111  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  33.48 
 
 		 1219 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  31.35 
 
 		 1091 aa  108  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 		 906 aa  108  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  41.04 
 
 		 1238 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  42.13 
 
 		 1083 aa  107  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.43 
 
 		 1165 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  35.63 
 
 		 1091 aa  107  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  39.59 
 
 		 1214 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 1224 aa  106  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  43.83 
 
 		 1227 aa  106  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  33.62 
 
 		 810 aa  106  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  29.72 
 
 		 1232 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  40.1 
 
 		 1101 aa  105  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  41.71 
 
 		 1042 aa  105  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  42.04 
 
 		 1232 aa  105  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  49.52 
 
 		 1234 aa  105  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  31.02 
 
 		 1085 aa  105  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  41.38 
 
 		 1155 aa  104  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  34.07 
 
 		 1213 aa  104  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  40.12 
 
 		 1048 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  40.12 
 
 		 1048 aa  103  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1047 aa  103  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1047 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  40.12 
 
 		 1048 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  45.1 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1047 aa  103  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1047 aa  103  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  38.92 
 
 		 1265 aa  103  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1047 aa  103  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  35.96 
 
 		 1214 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>