More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1387 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  100 
 
 
454 aa  880    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  40.37 
 
 
455 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  39.78 
 
 
477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  38.52 
 
 
449 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  38.05 
 
 
447 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  37.35 
 
 
447 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  40.47 
 
 
447 aa  289  6e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  37.99 
 
 
442 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  35.32 
 
 
455 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  34.88 
 
 
455 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  34.09 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  35.23 
 
 
454 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  33.8 
 
 
456 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  36.75 
 
 
454 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  33.18 
 
 
455 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  36.14 
 
 
455 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  33.8 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  35.45 
 
 
449 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  36.72 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  31.39 
 
 
466 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  38.12 
 
 
456 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  34.53 
 
 
448 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  31.89 
 
 
466 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  32.5 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  32.27 
 
 
464 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.79 
 
 
452 aa  216  9e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.04 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  29.09 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
451 aa  213  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
460 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.17 
 
 
496 aa  209  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.5 
 
 
462 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  31.26 
 
 
451 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.83 
 
 
451 aa  200  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  34.32 
 
 
493 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  31.25 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.16 
 
 
461 aa  196  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
448 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
470 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  31.07 
 
 
451 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.61 
 
 
451 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
451 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.73 
 
 
451 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  30.73 
 
 
451 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
451 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
452 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.5 
 
 
451 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.17 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.39 
 
 
451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  30.16 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
450 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.6 
 
 
452 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
464 aa  180  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
451 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.02 
 
 
472 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  32.52 
 
 
472 aa  176  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
447 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
459 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.07 
 
 
467 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  32.91 
 
 
467 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
451 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
440 aa  170  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.95 
 
 
460 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.04 
 
 
468 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  33 
 
 
445 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.53 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  27.15 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.2 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
461 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.13 
 
 
496 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.5 
 
 
440 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.65 
 
 
455 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.44 
 
 
446 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.8 
 
 
465 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
485 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
459 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.22 
 
 
467 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  28.5 
 
 
442 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.68 
 
 
464 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.65 
 
 
452 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27 
 
 
446 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27 
 
 
448 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.22 
 
 
499 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.63 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.95 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
437 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  31.92 
 
 
485 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 
448 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
437 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
490 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.15 
 
 
485 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>