81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0320 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 361 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  73.2 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  63.39 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  66.3 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  65.67 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  65.03 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  62.91 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  64.5 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  58.52 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  63.76 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.05 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  59.78 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  57.77 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  59.03 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  58.97 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59.67 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  60.49 
 
 		 457 aa  361  9e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  58.7 
 
 		 557 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  57.64 
 
 		 467 aa  351  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  56.33 
 
 		 464 aa  345  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  54.62 
 
 		 452 aa  339  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  58.33 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  56.3 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  54.37 
 
 		 466 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  57.1 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  53.28 
 
 		 505 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  57.14 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.12 
 
 		 461 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  58.11 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  56.12 
 
 		 468 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  54.89 
 
 		 489 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.97 
 
 		 462 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  55.53 
 
 		 415 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.91 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  51.08 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  50.53 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  54.32 
 
 		 446 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.97 
 
 		 459 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.52 
 
 		 478 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.08 
 
 		 462 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  54.43 
 
 		 477 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  47.62 
 
 		 439 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  54.69 
 
 		 473 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  49.4 
 
 		 433 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  50.81 
 
 		 476 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.04 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  38.86 
 
 		 481 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  37.47 
 
 		 523 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  41.75 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.52 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  37.95 
 
 		 532 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.62 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.73 
 
 		 477 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.34 
 
 		 501 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.83 
 
 		 477 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.85 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  56.52 
 
 		 840 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  54.35 
 
 		 673 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.06 
 
 		 767 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.95 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  31.37 
 
 		 863 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.24 
 
 		 2160 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.69 
 
 		 852 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.02 
 
 		 530 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.81 
 
 		 523 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  26.62 
 
 		 575 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.67 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  40 
 
 		 987 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.85 
 
 		 1296 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.8 
 
 		 572 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.21 
 
 		 575 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  26.19 
 
 		 1672 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  41.51 
 
 		 717 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.13 
 
 		 1037 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.68 
 
 		 1197 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  25.09 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.87 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1003 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  31.37 
 
 		 558 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1318 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>