158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0537 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  554  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  78.21 
 
 		 258 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  77.43 
 
 		 257 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  77.04 
 
 		 257 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  76.77 
 
 		 257 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  33.18 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.48 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 2654 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.99 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.56 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.49 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  24.41 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.34 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  23.6 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.07 
 
 		 1279 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.6 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.09 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  31.16 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  20.97 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  22.64 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.82 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  21.03 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.45 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.39 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.39 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  28.22 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 1322 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  26.76 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.79 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.36 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  24.6 
 
 		 576 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  27.62 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  22.98 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2578  extracellular solute-binding protein  20.38 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 483 aa  48.9  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  23.04 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  22.51 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.44 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  23.04 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.96 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  22.51 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  22.55 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.27 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  23.3 
 
 		 618 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  23.15 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  21.33 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  23.66 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  22.58 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  22.58 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  23.78 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  24.85 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  22.61 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.44 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3251  hypothetical protein  25.48 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  26.22 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  20.75 
 
 		 1574 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>