More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0173 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  80.65 
 
 		 2073 aa  3219    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  78.86 
 
 		 2078 aa  3127    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  61.59 
 
 		 1014 aa  929    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  77.48 
 
 		 2091 aa  3072    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  100 
 
 		 2078 aa  4075    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  75.75 
 
 		 2075 aa  2978    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  75.57 
 
 		 2092 aa  2983    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  60.97 
 
 		 1813 aa  2119    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  34.65 
 
 		 3554 aa  406  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  69.47 
 
 		 1411 aa  327  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  73.91 
 
 		 209 aa  292  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  60.15 
 
 		 601 aa  281  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  32.94 
 
 		 3737 aa  261  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  29.85 
 
 		 4238 aa  227  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.45 
 
 		 2914 aa  189  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  38.59 
 
 		 3920 aa  189  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  29.88 
 
 		 4526 aa  155  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  41.15 
 
 		 998 aa  149  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.27 
 
 		 2851 aa  149  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  27.95 
 
 		 5143 aa  146  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  30.87 
 
 		 3078 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.56 
 
 		 2906 aa  129  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.81 
 
 		 1230 aa  128  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  46.43 
 
 		 563 aa  119  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  50.42 
 
 		 691 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  50.42 
 
 		 600 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  45.19 
 
 		 1333 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.72 
 
 		 595 aa  112  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  43.57 
 
 		 565 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  43.38 
 
 		 1065 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  48.08 
 
 		 1212 aa  102  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45.37 
 
 		 572 aa  97.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  32.82 
 
 		 314 aa  92.8  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 		 367 aa  92.8  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  28.92 
 
 		 4384 aa  92  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  28.35 
 
 		 3635 aa  91.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  27.61 
 
 		 2095 aa  85.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.92 
 
 		 4191 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  25.86 
 
 		 1516 aa  82.8  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  24.5 
 
 		 2868 aa  82.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30.34 
 
 		 2392 aa  81.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.46 
 
 		 4726 aa  79.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.62 
 
 		 827 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  29.51 
 
 		 1259 aa  74.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  28.99 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  26.04 
 
 		 1654 aa  72.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  28.99 
 
 		 1190 aa  72.4  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.8 
 
 		 1068 aa  72.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.09 
 
 		 1405 aa  71.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  25.19 
 
 		 617 aa  70.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48 
 
 		 1390 aa  70.1  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  46.74 
 
 		 1440 aa  69.3  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  46.67 
 
 		 2504 aa  68.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.81 
 
 		 1186 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  26.29 
 
 		 1451 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.65 
 
 		 1012 aa  67  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  27.83 
 
 		 2832 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  24.6 
 
 		 735 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  30.33 
 
 		 962 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  31.6 
 
 		 3718 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  28.29 
 
 		 2493 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  31.02 
 
 		 1072 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  40.71 
 
 		 1613 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  26.67 
 
 		 3192 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.44 
 
 		 386 aa  63.9  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  37.14 
 
 		 551 aa  63.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  28.48 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  44.32 
 
 		 990 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.14 
 
 		 270 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  42.39 
 
 		 3126 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  25.6 
 
 		 536 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  25.85 
 
 		 472 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  38.89 
 
 		 1246 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  26.37 
 
 		 2396 aa  60.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  26.32 
 
 		 1616 aa  59.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  26.32 
 
 		 1616 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1616 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.11 
 
 		 1326 aa  58.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.46 
 
 		 1713 aa  58.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  37.7 
 
 		 224 aa  58.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  28.21 
 
 		 404 aa  58.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  30.58 
 
 		 548 aa  58.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  38.78 
 
 		 963 aa  57.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  27.09 
 
 		 589 aa  57.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  25.24 
 
 		 737 aa  57  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  29.68 
 
 		 599 aa  56.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.5 
 
 		 270 aa  56.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 491 aa  56.2  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 727 aa  56.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  26.01 
 
 		 418 aa  55.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  36.26 
 
 		 229 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.69 
 
 		 707 aa  55.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  25.48 
 
 		 1471 aa  55.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  42.47 
 
 		 1197 aa  55.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  25.48 
 
 		 1471 aa  55.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  42.47 
 
 		 1197 aa  55.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>