288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0145 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  899    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  47.98 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  46.32 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  45.47 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  31.75 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  32.61 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.77 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 483 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.65 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.32 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.52 
 
 		 479 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.72 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.7 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.16 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.3 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  21.07 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.2 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  22.45 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  43.64 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.88 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.4 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  22.4 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  41.82 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  48 
 
 		 618 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  21.22 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.87 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  20.99 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.8 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  23.04 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  23.98 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>