More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3139 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  64.12 
 
 		 793 aa  1040    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  45.82 
 
 		 800 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 795 aa  1603    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  49.63 
 
 		 788 aa  745    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  54.39 
 
 		 795 aa  805    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  49.63 
 
 		 788 aa  744    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  63.11 
 
 		 784 aa  934    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  64.74 
 
 		 793 aa  1052    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  45.79 
 
 		 800 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  44.42 
 
 		 799 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 853 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  39.79 
 
 		 843 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  40.47 
 
 		 795 aa  522  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  40.8 
 
 		 803 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 811 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  39.07 
 
 		 811 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  41.7 
 
 		 803 aa  512  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 797 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  39.32 
 
 		 797 aa  502  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  39.32 
 
 		 797 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 812 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  39.59 
 
 		 812 aa  499  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 		 817 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 812 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 797 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  37.51 
 
 		 840 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  38.8 
 
 		 797 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 933 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 948 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  39.5 
 
 		 884 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  38.25 
 
 		 811 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 815 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  37.48 
 
 		 821 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 817 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 853 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  38.7 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 847 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  35.52 
 
 		 823 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  34.9 
 
 		 961 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.82 
 
 		 856 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 804 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  32.95 
 
 		 870 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 871 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.13 
 
 		 832 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.73 
 
 		 848 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 847 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 868 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 842 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 858 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 851 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 800 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 818 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 857 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 858 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 874 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 861 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 842 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 813 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 924 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 867 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 867 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 887 aa  364  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 833 aa  363  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.61 
 
 		 867 aa  363  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 877 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 885 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 987 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 872 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.93 
 
 		 864 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 870 aa  337  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 816 aa  330  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 947 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 850 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 924 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 873 aa  307  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 849 aa  299  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 852 aa  293  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.14 
 
 		 1015 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 879 aa  258  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  31.84 
 
 		 948 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 869 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 871 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 861 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 857 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 861 aa  178  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 861 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 951 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 953 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.96 
 
 		 834 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 897 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 817 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 874 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 904 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 904 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 904 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 866 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 904 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>