More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1693 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 858 aa  1733    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 795 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.87 
 
 		 784 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 813 aa  373  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 818 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 847 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 842 aa  364  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 883 aa  360  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 840 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  33.77 
 
 		 884 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.53 
 
 		 800 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 793 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.89 
 
 		 793 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 811 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 800 aa  347  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 816 aa  343  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  33.48 
 
 		 821 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 885 aa  336  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 853 aa  335  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 815 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 843 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 803 aa  326  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.61 
 
 		 811 aa  323  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 817 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.71 
 
 		 961 aa  320  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 803 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 811 aa  319  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 812 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.12 
 
 		 832 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 812 aa  317  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 797 aa  317  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 797 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 812 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 797 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 933 aa  313  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 797 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 835 aa  307  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 797 aa  302  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.19 
 
 		 799 aa  300  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.07 
 
 		 788 aa  298  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 795 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  30.99 
 
 		 795 aa  294  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 788 aa  293  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 857 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 873 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 817 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 847 aa  277  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 871 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 867 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 867 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 815 aa  274  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 842 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 851 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 987 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 918 aa  263  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 870 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 924 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.93 
 
 		 823 aa  260  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 833 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 877 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 849 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 800 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 872 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 879 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 947 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 868 aa  247  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 850 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  29.5 
 
 		 848 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 852 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 948 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  26.61 
 
 		 864 aa  228  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  28.45 
 
 		 870 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 924 aa  220  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 887 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 948 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 874 aa  206  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 869 aa  168  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 861 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 858 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  39.47 
 
 		 856 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  40.96 
 
 		 867 aa  149  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.18 
 
 		 1015 aa  147  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 869 aa  137  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 893 aa  128  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 879 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 843 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 874 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 866 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 852 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 973 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 861 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 861 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 950 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 987 aa  107  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 861 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 941 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 941 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>