120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0777 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 441 aa  868    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  45.31 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  28.6 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  28.9 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 539 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  50.39 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  25.98 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  36.23 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.56 
 
 		 496 aa  99.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  33.74 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 495 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  27.25 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.79 
 
 		 517 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.7 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  24.37 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  31.86 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.4 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 582 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  26.01 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  33.09 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  25.55 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.93 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 488 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  24.07 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.08 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  19.36 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1738  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.405975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  20.47 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  27.64 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  20.85 
 
 		 508 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  31.46 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 539 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.05 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 583 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  21.53 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>