281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0382 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  100 
 
 
216 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  6.07321e-13 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  93.52 
 
 
216 aa  423  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  93.52 
 
 
216 aa  423  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  50.47 
 
 
221 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  46.64 
 
 
240 aa  196  2e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  46.64 
 
 
240 aa  196  2e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  46.64 
 
 
240 aa  196  2e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  44.08 
 
 
218 aa  184  1e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  45.21 
 
 
221 aa  183  2e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 
221 aa  183  2e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  44.71 
 
 
218 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  44.08 
 
 
229 aa  172  3e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  45.64 
 
 
217 aa  172  4e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  45.41 
 
 
216 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  46.35 
 
 
215 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  45.31 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  37.21 
 
 
216 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  42.72 
 
 
236 aa  152  3e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.24176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
228 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
229 aa  139  5e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  54.47 
 
 
133 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  37.56 
 
 
222 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.86349e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  39.42 
 
 
204 aa  134  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  38.43 
 
 
243 aa  132  4e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  36.71 
 
 
231 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  37.16 
 
 
243 aa  130  2e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  38.97 
 
 
230 aa  127  1e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  46.88 
 
 
237 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
240 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  34.88 
 
 
221 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  33.65 
 
 
232 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.08036e-07  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  31.75 
 
 
234 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.61 
 
 
207 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.88 
 
 
220 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.3506e-09  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.07 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.97465e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  33.49 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  38.89 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  30.05 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  6.5299e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  29.91 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.95428e-05  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.15 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  1.54774e-08 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  31.25 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  28.02 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  40.32 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  31.28 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  25.94 
 
 
217 aa  84.3  1e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  6.01077e-07  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  58.73 
 
 
135 aa  82  6e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  58.73 
 
 
135 aa  82  6e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 
222 aa  81.3  1e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  45 
 
 
135 aa  80.5  2e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  45 
 
 
135 aa  80.5  2e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  53.62 
 
 
233 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  53.62 
 
 
233 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  53.62 
 
 
233 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  47.13 
 
 
217 aa  79  5e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.00264e-09  decreased coverage  1.0366e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  52.24 
 
 
240 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  52.24 
 
 
240 aa  78.6  6e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  51.56 
 
 
229 aa  73.9  2e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  51.56 
 
 
229 aa  73.9  2e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  48.48 
 
 
229 aa  72  7e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  24.88 
 
 
213 aa  72  7e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  48.44 
 
 
263 aa  70.1  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  31.01 
 
 
238 aa  70.5  2e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  31.01 
 
 
216 aa  70.5  2e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  5.55461e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  28.63 
 
 
239 aa  68.6  7e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  1.25637e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  46.27 
 
 
131 aa  67  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.18001e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.43 
 
 
196 aa  64.7  1e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.43 
 
 
243 aa  64.3  1e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  37.21 
 
 
243 aa  64.3  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46435e-05 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.91 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  34.11 
 
 
202 aa  62.8  4e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.85 
 
 
227 aa  61.2  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  37.5 
 
 
186 aa  59.7  3e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  36.13 
 
 
153 aa  59.3  4e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  28 
 
 
214 aa  58.5  8e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  33.08 
 
 
150 aa  56.2  3e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.55 
 
 
206 aa  56.6  3e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  25.63 
 
 
228 aa  56.6  3e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  2.74718e-08  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  38.14 
 
 
129 aa  56.2  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.19 
 
 
143 aa  55.5  6e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 
380 aa  55.5  6e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  30.61 
 
 
208 aa  55.5  7e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
206 aa  55.5  7e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.43 
 
 
201 aa  54.7  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  35.25 
 
 
147 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.98 
 
 
234 aa  53.9  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  35 
 
 
206 aa  53.1  3e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32.93 
 
 
203 aa  53.1  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  35.66 
 
 
201 aa  53.1  3e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.13097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 
245 aa  52.4  5e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  33.73 
 
 
201 aa  52  7e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
152 aa  52  7e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.11 
 
 
222 aa  51.6  8e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  7.99679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 
201 aa  51.2  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  25.73 
 
 
210 aa  50.8  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  35.96 
 
 
126 aa  50.8  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
152 aa  51.2  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.78 
 
 
213 aa  51.2  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  9.13387e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.46 
 
 
147 aa  51.2  1e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.06 
 
 
217 aa  50.8  1e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>