More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0666 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 615 aa  1262    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.12 
 
 		 676 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  37.09 
 
 		 662 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 715 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 		 680 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 645 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 678 aa  293  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  33.5 
 
 		 642 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 710 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 687 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  26.08 
 
 		 718 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.01 
 
 		 667 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  37.27 
 
 		 670 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 697 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25.04 
 
 		 704 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 653 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.97 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 687 aa  107  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 714 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 684 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  33.52 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  36.81 
 
 		 705 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 680 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 707 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.5 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 679 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  21.66 
 
 		 655 aa  100  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 710 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.08 
 
 		 652 aa  97.1  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  36.81 
 
 		 673 aa  97.1  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 715 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  21.46 
 
 		 634 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 893 aa  94.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.02 
 
 		 656 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 671 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.81 
 
 		 686 aa  94  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 699 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  33.1 
 
 		 704 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 681 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  33.1 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 641 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 715 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.61 
 
 		 728 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 668 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 640 aa  90.9  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.33 
 
 		 666 aa  90.5  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 680 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.32 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.32 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.87 
 
 		 656 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.33 
 
 		 666 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.73 
 
 		 666 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.33 
 
 		 666 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 678 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.84 
 
 		 680 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 682 aa  87.4  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.21 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 627 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 666 aa  87  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  22.38 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 698 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.98 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 626 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.98 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.19 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.98 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  31.15 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.2 
 
 		 698 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  24.03 
 
 		 696 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.08 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.9 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 670 aa  84  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 624 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 737 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  31.31 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 709 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.86 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  22.42 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>