162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1522 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  34.42 
 
 		 1172 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  100 
 
 		 1181 aa  2443    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  35.51 
 
 		 1182 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1176 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  32.97 
 
 		 1171 aa  635  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1102 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  30.6 
 
 		 1199 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  30.73 
 
 		 1220 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  31.76 
 
 		 1211 aa  549  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1205 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1208 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  30.02 
 
 		 1209 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.83 
 
 		 1209 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 1209 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.03 
 
 		 1209 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  29.29 
 
 		 1212 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  28.27 
 
 		 1164 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  28.94 
 
 		 1218 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  28.36 
 
 		 1207 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  28.43 
 
 		 1175 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1192 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  27.52 
 
 		 1181 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1179 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  28.93 
 
 		 1148 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1168 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.97 
 
 		 1173 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  27.89 
 
 		 1157 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  27.58 
 
 		 1204 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  26.17 
 
 		 1302 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1173 aa  426  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28.05 
 
 		 1152 aa  426  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  26.25 
 
 		 1302 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  26.17 
 
 		 1302 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.55 
 
 		 1179 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1175 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  27.29 
 
 		 1302 aa  413  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1175 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  27.79 
 
 		 1176 aa  406  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.11 
 
 		 1302 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  25.19 
 
 		 1329 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  26.29 
 
 		 1289 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  26.29 
 
 		 1289 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.29 
 
 		 1289 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.13 
 
 		 1289 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.6 
 
 		 1348 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.07 
 
 		 1302 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.45 
 
 		 1187 aa  361  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1208 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.6 
 
 		 1268 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 1194 aa  350  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.51 
 
 		 1182 aa  347  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.15 
 
 		 1194 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1332 aa  324  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.73 
 
 		 1206 aa  325  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25 
 
 		 1206 aa  321  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.38 
 
 		 1165 aa  320  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  26.25 
 
 		 1177 aa  315  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 1177 aa  315  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  24.43 
 
 		 1205 aa  313  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1275 aa  313  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  26.12 
 
 		 1275 aa  313  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  23.13 
 
 		 1165 aa  310  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1008 aa  310  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  23.49 
 
 		 1165 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  24.4 
 
 		 1365 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  24.62 
 
 		 1317 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.52 
 
 		 1365 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1369 aa  297  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  26.23 
 
 		 1150 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1174 aa  283  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1174 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1195 aa  280  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  25.07 
 
 		 1366 aa  280  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  23.74 
 
 		 1153 aa  279  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1153 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1270 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.09 
 
 		 1230 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  24.4 
 
 		 1358 aa  255  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  24.4 
 
 		 1358 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  24.3 
 
 		 1358 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  23.14 
 
 		 1288 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1164 aa  240  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1315 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  23.27 
 
 		 1164 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  29.2 
 
 		 830 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  27.78 
 
 		 1313 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  27.7 
 
 		 1314 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  27.78 
 
 		 1313 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  27.7 
 
 		 1314 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  27.7 
 
 		 1314 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  29.21 
 
 		 1301 aa  229  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  30.2 
 
 		 830 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1297 aa  227  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  28.21 
 
 		 1315 aa  227  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1297 aa  227  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>