More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1198 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  54.95 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 461 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  47.44 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  43.89 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  40.54 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  43.12 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  43.12 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  41.36 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  43.38 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.43 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  39.45 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  39.46 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.84 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  42.45 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  41.98 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.1 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 272 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  38.62 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  41.1 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  41.67 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  38.62 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  37.76 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.73 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  35.34 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.22 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>