208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1982 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  58.76 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  48.44 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  41.15 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 253 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  61.22 
 
 		 307 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  68.97 
 
 		 261 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  63.38 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  31.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  34.16 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  63.64 
 
 		 1556 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  33.61 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  48.48 
 
 		 509 aa  54.7  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  60.87 
 
 		 429 aa  54.3  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  54.17 
 
 		 520 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  58.7 
 
 		 448 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  42.47 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  43.94 
 
 		 332 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1214  peptidoglycan-binding LysM  41.89 
 
 		 1130 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.82 
 
 		 568 aa  52  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  52.27 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 128 aa  51.2  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  52.27 
 
 		 361 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  54.55 
 
 		 372 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 399 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  30 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  30 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  30 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  56.25 
 
 		 372 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 445 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  56.25 
 
 		 372 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  36.71 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.25 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.25 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  34.44 
 
 		 390 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  37.04 
 
 		 272 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.25 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  30 
 
 		 466 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  46.51 
 
 		 320 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.98 
 
 		 303 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  27.68 
 
 		 376 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 544 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  43.84 
 
 		 414 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  50 
 
 		 301 aa  48.5  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0696  aggregation promoting factor-like surface protein  49.21 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000939064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0889  LysM domain-containing protein  45.45 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000446725 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  45.71 
 
 		 436 aa  48.5  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  50 
 
 		 520 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  48.84 
 
 		 503 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  51.11 
 
 		 390 aa  48.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  40.35 
 
 		 420 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  40.26 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 590 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 440 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.14 
 
 		 470 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 587 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  50 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 341 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.68 
 
 		 754 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  58.14 
 
 		 75 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  48.84 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  38.6 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 661 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 		 1079 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 		 390 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.83 
 
 		 751 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  41.3 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  37.14 
 
 		 560 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  36.84 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.19 
 
 		 443 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  50 
 
 		 397 aa  45.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  46.94 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.22 
 
 		 727 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  46.15 
 
 		 315 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  46.15 
 
 		 315 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  42.31 
 
 		 520 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  34.09 
 
 		 395 aa  45.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.22 
 
 		 727 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  42.31 
 
 		 520 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 301 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 647 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  32.63 
 
 		 744 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>