More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0136 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 211 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.35 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  46.15 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.56 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.88 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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