More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6276 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  67.88 
 
 		 512 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 496 aa  1022    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  58.81 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  51.02 
 
 		 511 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  43.61 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  43.38 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  42.2 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 529 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  39.52 
 
 		 513 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  39.65 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  41.42 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  40.99 
 
 		 529 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  40.57 
 
 		 527 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  37.96 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 535 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  37.78 
 
 		 534 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.82 
 
 		 526 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 540 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  33.81 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 527 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 527 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 545 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.92 
 
 		 545 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.66 
 
 		 538 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 536 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.97 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 		 513 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  32.96 
 
 		 540 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.87 
 
 		 535 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 535 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 537 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  33.05 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  34.69 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.89 
 
 		 516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 515 aa  213  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 537 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  31.47 
 
 		 514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 538 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 503 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 505 aa  153  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 561 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.84 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.77 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 523 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.77 
 
 		 513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 522 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.66 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.25 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.46 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.82 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>