More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0566 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  71.56 
 
 		 440 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  89.46 
 
 		 423 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  87.06 
 
 		 451 aa  804    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  69.7 
 
 		 446 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  70.86 
 
 		 440 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  95.19 
 
 		 457 aa  866    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  92.89 
 
 		 452 aa  841    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 456 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  88.38 
 
 		 451 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  94.32 
 
 		 458 aa  871    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  69.48 
 
 		 440 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  69.48 
 
 		 440 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  69.48 
 
 		 440 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  68.16 
 
 		 453 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  70.14 
 
 		 447 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  69.23 
 
 		 444 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  69.39 
 
 		 445 aa  604  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  59.78 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  66.92 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  60.31 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  60.31 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  59.41 
 
 		 440 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  59.68 
 
 		 442 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  58.35 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  62.25 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  63 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  58.19 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  59.35 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  53.58 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  60.11 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  52.51 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  52.51 
 
 		 448 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  55.28 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  54.2 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  54.23 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  50.34 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  52.17 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  51.31 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.67 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.82 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.42 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  51.55 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.42 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.79 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.19 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.25 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  51.41 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  46.45 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  48.85 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  51.15 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  48.73 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  46.37 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  50.65 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  50.13 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.22 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  48.77 
 
 		 437 aa  362  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.84 
 
 		 443 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.43 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  53.61 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  51.05 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.98 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.64 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  52.94 
 
 		 449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.27 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  50.27 
 
 		 483 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  48.87 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  48.87 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  46.35 
 
 		 444 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.13 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.49 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.49 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.15 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.52 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  49.46 
 
 		 482 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  49.46 
 
 		 482 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  50.82 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  50.29 
 
 		 463 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  47.34 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  46.83 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  48.66 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  45.85 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.46 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  47.19 
 
 		 478 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  46.17 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.42 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  46.17 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  43.88 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  47.35 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  44.29 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  46.97 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  49.56 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>