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for query gene PputW619_0346 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  457  1e-128  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  96.82 
 
 
221 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  96.36 
 
 
221 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  96.82 
 
 
221 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  81.82 
 
 
223 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  68.95 
 
 
220 aa  311  3e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  67.44 
 
 
215 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  67.44 
 
 
215 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  68.04 
 
 
245 aa  308  6e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  68.04 
 
 
220 aa  304  8e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
227 aa  213  2e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
242 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
211 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
215 aa  141  1e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
215 aa  140  2e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
215 aa  140  2e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
213 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
215 aa  139  4e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  138  5e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
215 aa  138  5e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36887e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  138  5e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  1.33916e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  34.31 
 
 
214 aa  136  3e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  39.25 
 
 
211 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
211 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
217 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
215 aa  134  1e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
235 aa  133  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  32.85 
 
 
220 aa  132  4e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
218 aa  131  7e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
225 aa  127  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
236 aa  127  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
238 aa  127  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
239 aa  126  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
241 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
241 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
244 aa  125  4e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
223 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 
231 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
251 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
251 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
252 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
247 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
219 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
236 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
239 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
253 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
239 aa  120  1e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
220 aa  119  2e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 
215 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
237 aa  111  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
218 aa  110  1e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
208 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
222 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
211 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
209 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
217 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
220 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
191 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  33.96 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
213 aa  84.3  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
220 aa  81.3  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  26.09 
 
 
221 aa  72.8  4e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  31.96 
 
 
215 aa  57  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 
206 aa  55.5  6e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
193 aa  55.1  9e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
194 aa  53.5  2e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 
185 aa  53.9  2e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
183 aa  53.5  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
332 aa  52  6e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  44.23 
 
 
204 aa  51.6  8e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
207 aa  51.6  9e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
207 aa  51.2  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  32.53 
 
 
179 aa  51.2  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 
199 aa  51.6  1e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.21 
 
 
198 aa  50.8  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
202 aa  51.2  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
204 aa  50.4  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
222 aa  50.8  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
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NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.03 
 
 
184 aa  50.8  2e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
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