More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0473 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
420 aa  859    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 
419 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 
419 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  33.1 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 
420 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
419 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
425 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
412 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
424 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.4 
 
 
438 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
411 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
414 aa  96.7  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.69 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.43 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.51 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.31 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  22.34 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.14 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 
410 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  24.39 
 
 
439 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 
452 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  23.61 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.91 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
522 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.22 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.62 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.85 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.9 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.62 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.83 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>