More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1270 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  64.67 
 
 		 212 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  62.09 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  59.21 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  61.22 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  38.93 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.41 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.04 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.1 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  39.6 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.73 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.93 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.92 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.86 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.86 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.46 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  35.17 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.86 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.45 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  33.55 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  32.05 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.18 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.89 
 
 		 415 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.23 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.51 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  37.04 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  32.69 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.19 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.64 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.87 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.37 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.62 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  30.34 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.77 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.06 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.64 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.78 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.87 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32.64 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.41 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.19 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.47 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 274 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  30.67 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  33.11 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.97 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  34.75 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32.17 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  34.9 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.78 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  30.25 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  29.8 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  52.54 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  52.54 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  28.28 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.87 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  32.68 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.94 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.24 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  30.46 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.16 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>