More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1726 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  100 
 
 		 588 aa  1155    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  47.38 
 
 		 593 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  46.19 
 
 		 594 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  45.79 
 
 		 606 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  45.02 
 
 		 605 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  45.12 
 
 		 632 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  43.64 
 
 		 593 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  42.99 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  45.54 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  41.09 
 
 		 590 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  41.44 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  40.58 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  42.67 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  42.64 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  39.12 
 
 		 591 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  39.39 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  43.82 
 
 		 591 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  39.39 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  38.92 
 
 		 593 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  38.58 
 
 		 590 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  41.02 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  41.01 
 
 		 591 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  40.92 
 
 		 619 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  41.36 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  41.6 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  40.47 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  39.23 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  39.17 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  39.23 
 
 		 591 aa  360  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.19 
 
 		 588 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  38.07 
 
 		 584 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.05 
 
 		 622 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.86 
 
 		 602 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.69 
 
 		 596 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.48 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.49 
 
 		 627 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  34.03 
 
 		 580 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.44 
 
 		 588 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.06 
 
 		 612 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  32.69 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 588 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.03 
 
 		 609 aa  259  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.43 
 
 		 589 aa  256  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.99 
 
 		 616 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.85 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 		 596 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.33 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.55 
 
 		 613 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.37 
 
 		 618 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.52 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.91 
 
 		 591 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.81 
 
 		 589 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.57 
 
 		 610 aa  240  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.23 
 
 		 611 aa  240  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.57 
 
 		 630 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.83 
 
 		 592 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  31.53 
 
 		 600 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.1 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.41 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.02 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  29.9 
 
 		 604 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 		 588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  30.02 
 
 		 619 aa  233  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  33.56 
 
 		 612 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.71 
 
 		 610 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.57 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.54 
 
 		 581 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.6 
 
 		 599 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.1 
 
 		 610 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.1 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.1 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  30.16 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.1 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.1 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.1 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.54 
 
 		 609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.65 
 
 		 605 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.23 
 
 		 609 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 592 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.1 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  29.94 
 
 		 610 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.38 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 		 613 aa  223  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  30.96 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.2 
 
 		 607 aa  223  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.29 
 
 		 610 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  31.41 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  31.41 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.16 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.46 
 
 		 592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.7 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.56 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.7 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.5 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  29.5 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>