More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2380 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
785 aa  1614    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  87.14 
 
 
911 aa  1439    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  39.97 
 
 
1039 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  35.66 
 
 
934 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.12 
 
 
859 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.46 
 
 
900 aa  336  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  33.96 
 
 
897 aa  333  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.2 
 
 
1068 aa  333  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.5 
 
 
963 aa  331  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.6 
 
 
992 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  32.7 
 
 
829 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  35.3 
 
 
924 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.98 
 
 
1324 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
1105 aa  283  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.19 
 
 
1056 aa  283  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  59.07 
 
 
751 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
1424 aa  271  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  31.73 
 
 
845 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
1088 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  33.74 
 
 
843 aa  270  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  59.39 
 
 
568 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.39 
 
 
568 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  28.19 
 
 
899 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  58.4 
 
 
1328 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 
767 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
1288 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 
1185 aa  258  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  33.44 
 
 
672 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  33.88 
 
 
675 aa  257  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  62.22 
 
 
444 aa  257  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.74 
 
 
1309 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  58.8 
 
 
1215 aa  251  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 
1262 aa  251  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.49 
 
 
680 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
843 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.1 
 
 
801 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  56.58 
 
 
454 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
814 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
1000 aa  244  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.03 
 
 
793 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  32.98 
 
 
1500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.06 
 
 
1131 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.22 
 
 
385 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  53.42 
 
 
1507 aa  235  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
953 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  51.87 
 
 
284 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.46 
 
 
771 aa  230  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1283 aa  230  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 
1125 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  32.28 
 
 
849 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  52.05 
 
 
311 aa  228  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  55.36 
 
 
919 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  48.45 
 
 
825 aa  227  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
1050 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 
577 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.65 
 
 
787 aa  224  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  31.56 
 
 
822 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  48.12 
 
 
725 aa  220  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.31 
 
 
1383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  31.17 
 
 
838 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 
1128 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.05 
 
 
1044 aa  215  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  52.05 
 
 
481 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.63 
 
 
1314 aa  214  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.95 
 
 
977 aa  210  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  52.5 
 
 
212 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.88 
 
 
885 aa  207  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 
1146 aa  207  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.97 
 
 
1404 aa  204  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.23 
 
 
991 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  49.77 
 
 
362 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.73 
 
 
1212 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.21 
 
 
1186 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  30.47 
 
 
1509 aa  195  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 
1311 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.04 
 
 
1523 aa  191  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  52.43 
 
 
190 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  48.4 
 
 
799 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.28 
 
 
713 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  31.15 
 
 
457 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
857 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
1136 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  39.62 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
776 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
850 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28 
 
 
1228 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
443 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.94 
 
 
2145 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  33.03 
 
 
373 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  29.66 
 
 
1010 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  51.06 
 
 
235 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
669 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  32.75 
 
 
1488 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  41.49 
 
 
238 aa  144  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
1028 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 
966 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  44.79 
 
 
358 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  41.18 
 
 
237 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
469 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>