More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0010 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  95.68 
 
 		 479 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  100 
 
 		 471 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  83.26 
 
 		 449 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  79.42 
 
 		 450 aa  634    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  76.87 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.55 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.07 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.25 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.25 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 468 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.52 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.94 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 437 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 542 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 405 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 533 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 472 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 439 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.91 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  40.54 
 
 		 198 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>