More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0035 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.41 
 
 
769 aa  1078  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  72.7 
 
 
765 aa  1159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.82 
 
 
760 aa  1150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.82 
 
 
760 aa  1150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
769 aa  1582  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
749 aa  653  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
751 aa  686  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
760 aa  606  1e-172  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  37.37 
 
 
776 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
779 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
775 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
775 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
751 aa  517  1e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
762 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  36.56 
 
 
762 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
758 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
751 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
1013 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
758 aa  493  1e-138  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1002 aa  466  1e-130  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
791 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
763 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  36.36 
 
 
755 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
748 aa  460  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
746 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
746 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
799 aa  455  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1002 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
748 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
756 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
762 aa  446  1e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
1002 aa  448  1e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  34.57 
 
 
759 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
743 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
762 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
774 aa  416  1e-115  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
752 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  37.82 
 
 
772 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.04 
 
 
745 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
745 aa  402  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
775 aa  401  1e-110  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  33.94 
 
 
745 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
755 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
757 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
759 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
771 aa  364  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  32.38 
 
 
993 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.68 
 
 
1003 aa  360  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  37.4 
 
 
783 aa  358  2e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  36.84 
 
 
755 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
770 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  38.07 
 
 
509 aa  334  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  38.57 
 
 
738 aa  329  9e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  36.35 
 
 
722 aa  330  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  36.1 
 
 
798 aa  327  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  34.8 
 
 
760 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  34.32 
 
 
732 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.68 
 
 
849 aa  315  2e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 
732 aa  315  2e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  37.52 
 
 
723 aa  313  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
731 aa  309  1e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  36.55 
 
 
508 aa  307  4e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  34.53 
 
 
772 aa  306  8e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
783 aa  304  3e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.31 
 
 
842 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.6 
 
 
856 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  29.19 
 
 
884 aa  295  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
770 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  29.1 
 
 
728 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.53 
 
 
566 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  29.58 
 
 
728 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 
368 aa  285  2e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 
855 aa  284  5e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.31 
 
 
1669 aa  276  1e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 
380 aa  275  2e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  32.39 
 
 
625 aa  271  3e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.15 
 
 
846 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  34.57 
 
 
567 aa  270  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.6 
 
 
683 aa  270  9e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
874 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  33.86 
 
 
812 aa  268  3e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.94 
 
 
960 aa  267  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
740 aa  267  6e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  34.27 
 
 
506 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.42 
 
 
852 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
721 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  28.03 
 
 
908 aa  265  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
709 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.39 
 
 
847 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.29 
 
 
980 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.1 
 
 
847 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
875 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.87 
 
 
847 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.12 
 
 
895 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  46.58 
 
 
528 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  31.97 
 
 
856 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  52.21 
 
 
498 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.61 
 
 
931 aa  256  1e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.56 
 
 
515 aa  256  1e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.07 
 
 
535 aa  256  2e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>