More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04231 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  62.33 
 
 		 692 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  62.15 
 
 		 680 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  63.95 
 
 		 658 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  100 
 
 		 602 aa  1229    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  50.35 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  45.47 
 
 		 776 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  46.3 
 
 		 755 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  43.75 
 
 		 626 aa  485  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  42.76 
 
 		 811 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  44.04 
 
 		 824 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  43.87 
 
 		 824 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  44.05 
 
 		 589 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  42.64 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  42.78 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  42.99 
 
 		 589 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.59 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  39.07 
 
 		 806 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.05 
 
 		 761 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 735 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.16 
 
 		 739 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.88 
 
 		 734 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.42 
 
 		 734 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 775 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38 
 
 		 751 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38 
 
 		 751 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.02 
 
 		 750 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.84 
 
 		 720 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 770 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 727 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  35.36 
 
 		 732 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37 
 
 		 709 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 779 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 776 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 		 714 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.17 
 
 		 751 aa  330  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 720 aa  330  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 		 741 aa  329  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  36.8 
 
 		 750 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 643 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 768 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 643 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 646 aa  327  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.5 
 
 		 648 aa  326  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 728 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 727 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.75 
 
 		 714 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.28 
 
 		 643 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.79 
 
 		 727 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 728 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 		 712 aa  323  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 		 718 aa  323  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 730 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 651 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 833 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 		 740 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  35.7 
 
 		 757 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  35.65 
 
 		 732 aa  321  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.13 
 
 		 654 aa  319  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  35.54 
 
 		 669 aa  319  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 		 709 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  34.64 
 
 		 654 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 		 712 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 713 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 713 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 713 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 		 658 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.56 
 
 		 640 aa  317  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  35.9 
 
 		 723 aa  317  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.69 
 
 		 761 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.09 
 
 		 796 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38.09 
 
 		 751 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  34.6 
 
 		 744 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.43 
 
 		 649 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 661 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 760 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 784 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  33.58 
 
 		 724 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.39 
 
 		 640 aa  309  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 706 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 		 679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.14 
 
 		 742 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  37.5 
 
 		 699 aa  308  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 679 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  33.96 
 
 		 679 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 810 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  36.02 
 
 		 756 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.84 
 
 		 757 aa  306  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.45 
 
 		 709 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 709 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 709 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 		 707 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  33.1 
 
 		 724 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 		 667 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  37.03 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>