More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1897 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1897  permease  100 
 
 		 831 aa  1672    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.31 
 
 		 817 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  37.34 
 
 		 814 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.99 
 
 		 813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  37.22 
 
 		 869 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.45 
 
 		 796 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.66 
 
 		 805 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 823 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.92 
 
 		 882 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  35.24 
 
 		 804 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.89 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  37.43 
 
 		 809 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.71 
 
 		 822 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.2 
 
 		 871 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.49 
 
 		 800 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 		 816 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 805 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 862 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 		 807 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.39 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.61 
 
 		 821 aa  366  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  34.32 
 
 		 805 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.28 
 
 		 913 aa  359  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.18 
 
 		 809 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.29 
 
 		 804 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 805 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.77 
 
 		 802 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.8 
 
 		 915 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.28 
 
 		 849 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.17 
 
 		 798 aa  346  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 808 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 		 883 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.1 
 
 		 821 aa  333  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  32.98 
 
 		 808 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.17 
 
 		 817 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 		 844 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.43 
 
 		 805 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.81 
 
 		 808 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.78 
 
 		 874 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.58 
 
 		 845 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.3 
 
 		 809 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.89 
 
 		 819 aa  321  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.9 
 
 		 811 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 		 893 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.82 
 
 		 865 aa  320  7.999999999999999e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.5 
 
 		 887 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32.59 
 
 		 816 aa  317  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.65 
 
 		 808 aa  316  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.71 
 
 		 803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.09 
 
 		 806 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.27 
 
 		 808 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 		 817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.31 
 
 		 855 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.91 
 
 		 805 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.88 
 
 		 810 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.49 
 
 		 919 aa  307  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  33.7 
 
 		 835 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  33.53 
 
 		 887 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.96 
 
 		 803 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.44 
 
 		 878 aa  297  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.93 
 
 		 843 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.95 
 
 		 810 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.32 
 
 		 848 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.88 
 
 		 861 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.51 
 
 		 888 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.78 
 
 		 820 aa  264  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 810 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.34 
 
 		 812 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.63 
 
 		 844 aa  256  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 879 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  31.16 
 
 		 819 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.97 
 
 		 880 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.43 
 
 		 810 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 809 aa  243  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 813 aa  239  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.4 
 
 		 884 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.69 
 
 		 828 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 		 846 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 810 aa  207  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.09 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.34 
 
 		 931 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 795 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 792 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 816 aa  131  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 794 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 784 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 805 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 790 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 802 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 797 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 816 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 795 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 810 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 805 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>