More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1889 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1889  permease  100 
 
 		 803 aa  1609    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  41.39 
 
 		 802 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  42.29 
 
 		 810 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  41.66 
 
 		 805 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  42.8 
 
 		 810 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  40.05 
 
 		 808 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  37.56 
 
 		 804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  36.1 
 
 		 798 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  36.23 
 
 		 806 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.61 
 
 		 804 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  32.68 
 
 		 796 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32.88 
 
 		 814 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  34.44 
 
 		 835 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.28 
 
 		 809 aa  351  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 		 817 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.85 
 
 		 809 aa  347  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.92 
 
 		 882 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.91 
 
 		 813 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.09 
 
 		 803 aa  327  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.57 
 
 		 821 aa  327  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.69 
 
 		 808 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.15 
 
 		 797 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.56 
 
 		 845 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.81 
 
 		 809 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.07 
 
 		 823 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.32 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.31 
 
 		 807 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  31.31 
 
 		 869 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.26 
 
 		 817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 		 822 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.24 
 
 		 805 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  32.44 
 
 		 800 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.14 
 
 		 805 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  31.08 
 
 		 831 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  30.22 
 
 		 805 aa  300  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  31.5 
 
 		 808 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.62 
 
 		 811 aa  296  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 808 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 		 816 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.14 
 
 		 805 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.45 
 
 		 812 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 		 844 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 805 aa  290  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 915 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.06 
 
 		 816 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.51 
 
 		 848 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.66 
 
 		 843 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.21 
 
 		 887 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 		 871 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  30.84 
 
 		 803 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.55 
 
 		 878 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.68 
 
 		 819 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 849 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.65 
 
 		 865 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 809 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.07 
 
 		 913 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.11 
 
 		 808 aa  260  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.36 
 
 		 855 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 813 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.66 
 
 		 887 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.85 
 
 		 919 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.64 
 
 		 810 aa  254  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.16 
 
 		 810 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.88 
 
 		 862 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 810 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.43 
 
 		 874 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 893 aa  245  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.49 
 
 		 844 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.91 
 
 		 817 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 821 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.43 
 
 		 880 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.22 
 
 		 861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.19 
 
 		 884 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.58 
 
 		 879 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.89 
 
 		 883 aa  230  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.66 
 
 		 819 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.54 
 
 		 888 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.21 
 
 		 820 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 		 846 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.29 
 
 		 807 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 		 828 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  26.79 
 
 		 931 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 795 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 818 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 791 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 789 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 798 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 808 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 797 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 805 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 		 777 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 		 811 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 770 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 791 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  23.82 
 
 		 804 aa  121  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 		 793 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>