More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1078 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  100 
 
 		 316 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  71.77 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  62.39 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  61.47 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  60.86 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  60.86 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  60.74 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  60 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  59.33 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  59.82 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  63.81 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  60 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  57.01 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  49.38 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  49.85 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  49.85 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  49.69 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  49.22 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  47.2 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  49.19 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  46.51 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  47.39 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  43.23 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  46.28 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.18 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  45.37 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  44.52 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  46.26 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  43.55 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  43.79 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  42.9 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  42.72 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  47.25 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  44.87 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  43.89 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  45.65 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  45.7 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  43.37 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  42.53 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  37.73 
 
 		 371 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  43.39 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  36.14 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  37.07 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  40.69 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  40.91 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  40.91 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  40.91 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  37.58 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  40.78 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  36.48 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  40.65 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  36.25 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  35.85 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  35.85 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  38.17 
 
 		 363 aa  191  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  37.79 
 
 		 351 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  38.23 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  39.17 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  36.77 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  38.33 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  38.33 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  38.01 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  37.67 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  36.99 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  39.54 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  37.21 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  36.12 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.79 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  35.29 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.22 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.88 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  38.52 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.56 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  34.29 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.89 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  39.24 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  36.21 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.16 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  37.58 
 
 		 292 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.82 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.78 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.84 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  36.42 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  32.75 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  32.76 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  34.65 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  35.12 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.01 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  33.77 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.01 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  33.02 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30.64 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  34.15 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.22 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  31.37 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  36.58 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  31.13 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.9 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>