More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2273 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  71.88 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  44.62 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  38.15 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.73 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.73 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  38.96 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  38.55 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  41.9 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  39.68 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  38.89 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  38.89 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  38.65 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  41.98 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  41.87 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  39.44 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.44 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  41.2 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.32 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  41.49 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  39.52 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.55 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.8 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  38.15 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  37.98 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  39.62 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  41.5 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.56 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  37.15 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.06 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.55 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  35.56 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  38.34 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  34.52 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  34.52 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  39.34 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  34.73 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  38.06 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  37.01 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  36.76 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4747  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  40.48 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  35.15 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  36.11 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  40.89 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  35.2 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>