287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2472 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  66.91 
 
 
273 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  62.5 
 
 
272 aa  374  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  47.45 
 
 
272 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  46.35 
 
 
274 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  46.57 
 
 
278 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  46.35 
 
 
282 aa  248  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  38.69 
 
 
274 aa  234  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  41.97 
 
 
274 aa  221  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  38.21 
 
 
274 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  40.44 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  37.96 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  36.3 
 
 
275 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  35.77 
 
 
273 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  39.92 
 
 
271 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  33.94 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  36.86 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  35.9 
 
 
263 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  36.63 
 
 
262 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  33.57 
 
 
284 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.33 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  33.45 
 
 
274 aa  171  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  35.34 
 
 
295 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  36.43 
 
 
265 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  34.83 
 
 
278 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  31.91 
 
 
274 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  34.06 
 
 
271 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  33.2 
 
 
279 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  30.48 
 
 
275 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  33.33 
 
 
273 aa  135  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.5 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.46 
 
 
274 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  27.46 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  24.82 
 
 
272 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.04 
 
 
287 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  25.18 
 
 
273 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.21 
 
 
303 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  24.82 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.75 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.5 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.82 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  25.44 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.8 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.65 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.34 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.89 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  24.62 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.26 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.98 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
183 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.17 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30 
 
 
174 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.12 
 
 
202 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.98 
 
 
188 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.74 
 
 
190 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
163 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.19 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.05 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.13 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.89 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.89 
 
 
186 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.35 
 
 
176 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.96 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  27.12 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.58 
 
 
171 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.37 
 
 
191 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.48 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.37 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.37 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.73 
 
 
215 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  29.31 
 
 
192 aa  58.9  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  26.36 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26.96 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.89 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  28.87 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.24 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.24 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.24 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.7 
 
 
186 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.8 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.24 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.95 
 
 
184 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.57 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
178 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.33 
 
 
185 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  28.73 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  26.35 
 
 
184 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.79 
 
 
188 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.85 
 
 
204 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.03 
 
 
194 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  28.43 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.03 
 
 
194 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  26.96 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  28.24 
 
 
189 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.73 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.87 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.99 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>