149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0689 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  62.29 
 
 		 655 aa  809    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  54.03 
 
 		 671 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  63.08 
 
 		 631 aa  811    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  100 
 
 		 642 aa  1290    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  66.36 
 
 		 658 aa  880    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  46.32 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  43.65 
 
 		 640 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  43.73 
 
 		 625 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  42.5 
 
 		 633 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  42.14 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  41.83 
 
 		 629 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  42.09 
 
 		 631 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  40.16 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  38.3 
 
 		 634 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  37.79 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  37.37 
 
 		 651 aa  415  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  37.48 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  37.32 
 
 		 630 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  37.64 
 
 		 630 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  34.33 
 
 		 605 aa  372  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  37.61 
 
 		 530 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  33.56 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  36.48 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  35.07 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  35.89 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  34.73 
 
 		 520 aa  260  6e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  34.89 
 
 		 519 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  33.82 
 
 		 521 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 346 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 519 aa  53.9  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  27.14 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  23.62 
 
 		 489 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.4 
 
 		 322 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  29.25 
 
 		 305 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  28.4 
 
 		 322 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.73 
 
 		 322 aa  51.2  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.81 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  27.42 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  27.56 
 
 		 433 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.03 
 
 		 508 aa  48.9  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  29.69 
 
 		 327 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.99 
 
 		 327 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  28.23 
 
 		 385 aa  48.5  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  30 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.37 
 
 		 325 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.99 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 473 aa  48.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  26.77 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 477 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 358 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  25.37 
 
 		 423 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.77 
 
 		 483 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  28.99 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 455 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 455 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  26.59 
 
 		 343 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 357 aa  47.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 357 aa  47.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 671 aa  47.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  28.91 
 
 		 369 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.48 
 
 		 334 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 464 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 363 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  30 
 
 		 311 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 512 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  30.28 
 
 		 767 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  26.24 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  26.47 
 
 		 693 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  30 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  27.83 
 
 		 320 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  27.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 692 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 482 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  26.67 
 
 		 423 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  26.47 
 
 		 693 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  27.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.7 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  28.57 
 
 		 361 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  29.2 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  28.12 
 
 		 369 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  26.77 
 
 		 485 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  24.63 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  28.12 
 
 		 369 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0173  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 368 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.579319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  26.77 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>