More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4195 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  100 
 
 		 343 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.01 
 
 		 351 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  82.3 
 
 		 356 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.36 
 
 		 350 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  82.91 
 
 		 349 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  85.45 
 
 		 348 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  80.85 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.52 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.23 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  80.52 
 
 		 345 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.07 
 
 		 350 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  77.81 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  80.57 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.25 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  77.75 
 
 		 354 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.36 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  80 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.7 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.88 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.11 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.2 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  60.26 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  61.61 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.15 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  63.7 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  57.54 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.13 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  62.34 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.1 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  58.77 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  59.75 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.57 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.44 
 
 		 327 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.28 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.44 
 
 		 327 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.2 
 
 		 326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.43 
 
 		 325 aa  361  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  59.34 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  59.51 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.15 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  60.61 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.73 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  62.03 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.68 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  60.26 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  60.32 
 
 		 332 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.16 
 
 		 328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  58.56 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  61.06 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.2 
 
 		 329 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  60.47 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.99 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.41 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.52 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.6 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  50.65 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  50.16 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  49.35 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  51.12 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  49.19 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  48.2 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  44.66 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.67 
 
 		 310 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  46.33 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  46.33 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  42.01 
 
 		 320 aa  246  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.27 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.1 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  43.51 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.11 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.23 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.9 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.21 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  43.55 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.02 
 
 		 594 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  33.23 
 
 		 589 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 469 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.31 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.67 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.8 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.85 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  34.5 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  35.1 
 
 		 441 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 444 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 471 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 450 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 462 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 472 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>