72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2358 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  100 
 
 
361 aa  707    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  43.21 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  42.12 
 
 
364 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  42.82 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  41.71 
 
 
364 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  42.82 
 
 
367 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  41.87 
 
 
370 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  39.94 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  40.33 
 
 
363 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  39.41 
 
 
388 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  40.87 
 
 
367 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  42.86 
 
 
383 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 
357 aa  225  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 
357 aa  225  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  37.87 
 
 
364 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  42.41 
 
 
368 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  42.55 
 
 
368 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  48.39 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  36.46 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  36.48 
 
 
366 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  44.71 
 
 
367 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  34.64 
 
 
358 aa  208  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  43.96 
 
 
377 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  41.18 
 
 
384 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  40.48 
 
 
380 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  47.73 
 
 
366 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  41.28 
 
 
383 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  38.94 
 
 
346 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  41.22 
 
 
359 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  42.07 
 
 
371 aa  202  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  38.75 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  38.98 
 
 
358 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  42.01 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  36.36 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  37.84 
 
 
359 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  53.44 
 
 
269 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  38.26 
 
 
385 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  38.75 
 
 
364 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  36.74 
 
 
346 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  36.7 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  36.45 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  36.7 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  36.52 
 
 
360 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  40.67 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
336 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  58.97 
 
 
168 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  45.31 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  32.62 
 
 
385 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  41.25 
 
 
371 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  36.99 
 
 
369 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  36.76 
 
 
369 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  38.93 
 
 
346 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  41.98 
 
 
388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  41.27 
 
 
344 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  41.8 
 
 
361 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  41.04 
 
 
385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  42.02 
 
 
355 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  35.83 
 
 
369 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  37.08 
 
 
369 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  36.72 
 
 
369 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  36.97 
 
 
389 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  36.4 
 
 
369 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  28.29 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  32.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  28.57 
 
 
642 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  28.31 
 
 
631 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  24.64 
 
 
602 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>