More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0811 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  50.77 
 
 		 1028 aa  974    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  42.14 
 
 		 1044 aa  707    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  39.11 
 
 		 1031 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  44.96 
 
 		 1038 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  42.26 
 
 		 1057 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  52.79 
 
 		 1095 aa  1018    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  41.81 
 
 		 1165 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  100 
 
 		 1201 aa  2411    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  38.74 
 
 		 1058 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  37.81 
 
 		 1046 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1201 aa  2411    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  38.88 
 
 		 1049 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  38.16 
 
 		 1045 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  45.59 
 
 		 724 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  33.03 
 
 		 1082 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  64.74 
 
 		 338 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 1177 aa  400  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  31.74 
 
 		 840 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.76 
 
 		 988 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  31.63 
 
 		 971 aa  229  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.39 
 
 		 969 aa  229  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 954 aa  228  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  30.43 
 
 		 945 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  30.45 
 
 		 952 aa  226  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  30.45 
 
 		 952 aa  226  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 952 aa  226  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.96 
 
 		 919 aa  224  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.54 
 
 		 966 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  29.91 
 
 		 952 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.65 
 
 		 933 aa  213  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.79 
 
 		 969 aa  212  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.23 
 
 		 1138 aa  208  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  30.85 
 
 		 973 aa  201  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.31 
 
 		 1144 aa  196  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.97 
 
 		 835 aa  196  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.24 
 
 		 915 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.12 
 
 		 941 aa  194  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.12 
 
 		 941 aa  194  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  30.16 
 
 		 1062 aa  193  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.08 
 
 		 916 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.08 
 
 		 915 aa  193  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 1145 aa  192  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.55 
 
 		 962 aa  191  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.04 
 
 		 952 aa  190  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.32 
 
 		 937 aa  188  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 1172 aa  188  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  32.33 
 
 		 1094 aa  185  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.56 
 
 		 960 aa  185  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.98 
 
 		 921 aa  184  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.89 
 
 		 1170 aa  183  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.11 
 
 		 1172 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.39 
 
 		 972 aa  181  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  28.4 
 
 		 956 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 877 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.67 
 
 		 801 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.84 
 
 		 1170 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 1129 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.1 
 
 		 964 aa  180  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.76 
 
 		 1169 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.61 
 
 		 805 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.86 
 
 		 1212 aa  178  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 1167 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.61 
 
 		 1169 aa  175  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.72 
 
 		 1160 aa  175  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 1136 aa  174  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 		 1167 aa  173  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1170 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.68 
 
 		 1167 aa  171  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 964 aa  171  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.42 
 
 		 1168 aa  169  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1170 aa  169  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 1137 aa  169  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 		 963 aa  168  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  29.02 
 
 		 957 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.28 
 
 		 940 aa  167  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  27.2 
 
 		 975 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.04 
 
 		 933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 		 963 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  29.48 
 
 		 1194 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.52 
 
 		 1160 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.73 
 
 		 829 aa  164  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 1147 aa  162  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 955 aa  162  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 923 aa  162  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.32 
 
 		 953 aa  158  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 969 aa  158  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  23.75 
 
 		 951 aa  158  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 958 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.77 
 
 		 949 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 900 aa  154  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 		 937 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  27.16 
 
 		 961 aa  152  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  27.67 
 
 		 922 aa  151  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.48 
 
 		 925 aa  151  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  27.93 
 
 		 958 aa  150  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 942 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.01 
 
 		 932 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.3 
 
 		 584 aa  150  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 947 aa  150  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 945 aa  148  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>