More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0901 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0901  protease Do  100 
 
 
509 aa  1004    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  59.37 
 
 
513 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  59.37 
 
 
513 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  55.34 
 
 
520 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  53.52 
 
 
527 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  52.54 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  54.72 
 
 
517 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  53.2 
 
 
505 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  52.89 
 
 
491 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  48.63 
 
 
504 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  48.33 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.36 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  48.61 
 
 
523 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  45.22 
 
 
526 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  45.06 
 
 
529 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  48.96 
 
 
501 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  46.32 
 
 
524 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  49.03 
 
 
525 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  45.4 
 
 
520 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  46.36 
 
 
527 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  45.78 
 
 
537 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  48.22 
 
 
508 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  43.82 
 
 
528 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.95 
 
 
523 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  47.8 
 
 
503 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  46.05 
 
 
516 aa  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  48.23 
 
 
496 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  47.8 
 
 
503 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  47.79 
 
 
496 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  48.38 
 
 
496 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  43.65 
 
 
528 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.25 
 
 
500 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.86 
 
 
501 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  45.09 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.66 
 
 
487 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  44.37 
 
 
508 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  43.41 
 
 
515 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  44.13 
 
 
501 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.7 
 
 
506 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.63 
 
 
493 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  44.23 
 
 
514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.08 
 
 
500 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  41.3 
 
 
523 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.37 
 
 
476 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.64 
 
 
483 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.73 
 
 
498 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.64 
 
 
483 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.26 
 
 
493 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  41.89 
 
 
524 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.66 
 
 
528 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.82 
 
 
483 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.41 
 
 
511 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.13 
 
 
471 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.22 
 
 
516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.18 
 
 
501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.83 
 
 
511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  46.21 
 
 
498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  42.8 
 
 
535 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 
476 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.83 
 
 
511 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.22 
 
 
475 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.33 
 
 
501 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  41.18 
 
 
522 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  43.9 
 
 
501 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.31 
 
 
473 aa  322  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  40.3 
 
 
578 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.51 
 
 
524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.51 
 
 
524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.95 
 
 
473 aa  319  7e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  40.26 
 
 
588 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42 
 
 
482 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.85 
 
 
520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  39.79 
 
 
524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.01 
 
 
481 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  42.98 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  44.85 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.48 
 
 
508 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.96 
 
 
457 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.33 
 
 
496 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 
497 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  40.25 
 
 
485 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  43.13 
 
 
499 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.71 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.63 
 
 
475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 
464 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.9 
 
 
525 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  42.58 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.47 
 
 
480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.83 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.03 
 
 
464 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  39.34 
 
 
449 aa  300  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  42.83 
 
 
489 aa  300  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.09 
 
 
479 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.61 
 
 
492 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.53 
 
 
477 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.23 
 
 
477 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.39 
 
 
458 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.66 
 
 
476 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.08 
 
 
499 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.87 
 
 
476 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>