More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0826 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  100 
 
 
165 aa  333  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  54.55 
 
 
164 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  49.64 
 
 
150 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  48.91 
 
 
150 aa  138  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  47.1 
 
 
151 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  42.14 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.18 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  41.73 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40.43 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.99 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  40.58 
 
 
148 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
145 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.24 
 
 
145 aa  103  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
148 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 
147 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.57 
 
 
147 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.24 
 
 
145 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.41 
 
 
142 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.32 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  41.3 
 
 
139 aa  97.1  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  37.23 
 
 
148 aa  92.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.25 
 
 
290 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.21 
 
 
153 aa  90.5  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
142 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  38.76 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.13 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.16 
 
 
144 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.97 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  34.45 
 
 
120 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.93 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  34.59 
 
 
301 aa  87  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  34.56 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.88 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.8 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.43 
 
 
158 aa  84  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.78 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.09 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.82 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.62 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  32.17 
 
 
283 aa  79  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.03 
 
 
142 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.35 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.65 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.25 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  33.33 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  32.39 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.51 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.6 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.06 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.78 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.62 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  31.58 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.62 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  31.91 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.71 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  33.79 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.06 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  33.09 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.88 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  27.34 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  30.43 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.93 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.72 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.57 
 
 
415 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>