More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0606 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 176 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  78.98 
 
 		 183 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  62.43 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  51.27 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  50.32 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  50.32 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  50.69 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  46.54 
 
 		 225 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  45.68 
 
 		 232 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  45.07 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  48.59 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  45.73 
 
 		 189 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  46.48 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  49.62 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  39.41 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  43.45 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.52 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  43.98 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  41.42 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  43.12 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  43.8 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  46.43 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  45.71 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  45.32 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  41.43 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  39.1 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.97 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  44.2 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 144 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  40.76 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  39.31 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  40.6 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  43.57 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  35.04 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  42.14 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  42.14 
 
 		 145 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  40.71 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  41.43 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  41.43 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  41.43 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  41.43 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  41.43 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  41.43 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  40.71 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.67 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  43.16 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.09 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.09 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 128 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.15 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  36.15 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  43 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  37.6 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  34.31 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>