More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1467 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  50.17 
 
 
866 aa  710    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  45.93 
 
 
839 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  54.34 
 
 
845 aa  744    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  51.03 
 
 
870 aa  727    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  45.4 
 
 
847 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  46.44 
 
 
850 aa  702    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  45.17 
 
 
847 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  44.44 
 
 
855 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  100 
 
 
849 aa  1668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  43.83 
 
 
843 aa  512  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
837 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  41.7 
 
 
843 aa  475  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  28.51 
 
 
851 aa  291  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.69 
 
 
858 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.07 
 
 
850 aa  273  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.64 
 
 
842 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
842 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
849 aa  250  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
842 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  29.68 
 
 
841 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  27.88 
 
 
855 aa  233  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  27.82 
 
 
836 aa  233  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  30.2 
 
 
857 aa  231  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  29.07 
 
 
855 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27 
 
 
858 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.15 
 
 
817 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.65 
 
 
817 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 
884 aa  225  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
844 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  24.65 
 
 
817 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.81 
 
 
879 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
877 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.77 
 
 
889 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 
857 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.94 
 
 
889 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
884 aa  203  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.31 
 
 
846 aa  201  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
835 aa  198  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  29.04 
 
 
835 aa  198  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.68 
 
 
878 aa  191  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  27.04 
 
 
887 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.32 
 
 
845 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  27.59 
 
 
820 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 
821 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  27.34 
 
 
819 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.84 
 
 
867 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.12 
 
 
887 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  26.78 
 
 
865 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  28.19 
 
 
853 aa  178  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.43 
 
 
889 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
800 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  26.07 
 
 
849 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  38.21 
 
 
846 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.71 
 
 
840 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  25.45 
 
 
850 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.23 
 
 
855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.01 
 
 
820 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.33 
 
 
847 aa  147  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  26.23 
 
 
793 aa  147  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 
803 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.11 
 
 
842 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.54 
 
 
843 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
852 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  27.86 
 
 
868 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
849 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  26.87 
 
 
802 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.45 
 
 
841 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.15 
 
 
813 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
834 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.37 
 
 
825 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  27.85 
 
 
897 aa  119  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.18 
 
 
877 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.64 
 
 
819 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.1 
 
 
821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
848 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  31.56 
 
 
866 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  30.53 
 
 
821 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
445 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.46 
 
 
820 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 
408 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  26.3 
 
 
836 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.35 
 
 
854 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.86 
 
 
872 aa  108  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
853 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 
856 aa  106  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  31.22 
 
 
826 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.84 
 
 
845 aa  105  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.2 
 
 
836 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.6 
 
 
821 aa  104  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  30.31 
 
 
800 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.65 
 
 
849 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.86 
 
 
815 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.8 
 
 
825 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23 
 
 
859 aa  100  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  23.63 
 
 
849 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
861 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
845 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  26.91 
 
 
819 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 
853 aa  92.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
838 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>