153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1616 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0209  large adhesin  48.67 
 
 
5143 aa  988    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  49.26 
 
 
3920 aa  1351    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  51.71 
 
 
4526 aa  1051    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  100 
 
 
3078 aa  6113    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  61.77 
 
 
3737 aa  613  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  58.53 
 
 
3554 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  51.03 
 
 
4238 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  48.87 
 
 
2906 aa  382  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.14 
 
 
2914 aa  237  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.55 
 
 
2851 aa  232  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  29.91 
 
 
2073 aa  137  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  29.1 
 
 
2078 aa  137  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  26.15 
 
 
1813 aa  135  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  30.87 
 
 
2078 aa  129  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  30.05 
 
 
2075 aa  125  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  33.33 
 
 
2091 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  33.33 
 
 
2092 aa  117  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  24.69 
 
 
1411 aa  99.8  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  32.77 
 
 
1014 aa  96.3  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  26.82 
 
 
1516 aa  89.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  34.78 
 
 
209 aa  87  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  26.67 
 
 
1333 aa  85.9  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.73 
 
 
691 aa  82.8  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.11 
 
 
827 aa  80.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  30.36 
 
 
1212 aa  80.5  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  28.72 
 
 
617 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  28.27 
 
 
1854 aa  77.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  26.52 
 
 
737 aa  77  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  28.57 
 
 
877 aa  76.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  26.34 
 
 
1546 aa  76.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  25.67 
 
 
1471 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  25.67 
 
 
1471 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  39.58 
 
 
1616 aa  73.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  39.58 
 
 
1616 aa  73.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  39.58 
 
 
1588 aa  73.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  39.58 
 
 
1616 aa  73.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.18 
 
 
1230 aa  73.6  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  39.58 
 
 
1674 aa  73.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  39.58 
 
 
1549 aa  73.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  39.58 
 
 
279 aa  73.2  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  28.66 
 
 
1265 aa  71.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  36.17 
 
 
1472 aa  70.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  36.17 
 
 
1447 aa  70.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  36.17 
 
 
1342 aa  70.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  36.17 
 
 
1447 aa  70.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.61 
 
 
1713 aa  70.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  36.17 
 
 
1446 aa  70.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.09 
 
 
1434 aa  69.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.07 
 
 
2095 aa  68.6  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  40.62 
 
 
2814 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  27.89 
 
 
1186 aa  67.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  25.37 
 
 
650 aa  67.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  28.39 
 
 
600 aa  67  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  35.32 
 
 
1405 aa  66.6  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  32.6 
 
 
1487 aa  66.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  27.98 
 
 
1012 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  29.44 
 
 
2866 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.78 
 
 
1068 aa  64.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  39.5 
 
 
589 aa  63.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  37.11 
 
 
716 aa  63.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1185  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  63.5  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  26.61 
 
 
962 aa  63.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  27.15 
 
 
599 aa  63.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  35.82 
 
 
548 aa  63.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  47.12 
 
 
2757 aa  62.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  47.57 
 
 
2025 aa  62.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  32.31 
 
 
2493 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  47.57 
 
 
1916 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  32.43 
 
 
1440 aa  62  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  34.86 
 
 
2396 aa  61.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.88 
 
 
575 aa  62  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.35 
 
 
810 aa  62  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  37.11 
 
 
716 aa  62  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  32.43 
 
 
1190 aa  61.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  35.96 
 
 
742 aa  61.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  29.11 
 
 
572 aa  60.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  40.32 
 
 
472 aa  60.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.62 
 
 
536 aa  60.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  32.43 
 
 
2504 aa  60.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.63 
 
 
597 aa  60.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.63 
 
 
597 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.63 
 
 
597 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  34.82 
 
 
330 aa  59.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  31.73 
 
 
898 aa  58.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.8 
 
 
4191 aa  58.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  33.33 
 
 
356 aa  57.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  39.81 
 
 
880 aa  57.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  38.41 
 
 
2157 aa  57.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  39.81 
 
 
878 aa  57.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  39.81 
 
 
876 aa  57.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  31.53 
 
 
1390 aa  57.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  25.24 
 
 
595 aa  56.6  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  25.1 
 
 
2832 aa  55.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.56 
 
 
492 aa  55.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  27.46 
 
 
1613 aa  53.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  27.31 
 
 
404 aa  53.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  36.36 
 
 
655 aa  53.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  38.98 
 
 
1065 aa  52.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  27.44 
 
 
815 aa  52.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  38.98 
 
 
740 aa  52.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>