More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3793 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  40.57 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.57 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 374 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  53.7 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  44.44 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>