104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1422 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  100 
 
 		 724 aa  1417    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  65.7 
 
 		 723 aa  932    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  21.27 
 
 		 664 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  33.87 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1194 aa  84.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  37.41 
 
 		 1163 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  20.22 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  28.82 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  34.52 
 
 		 1167 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1157 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  27.27 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  33.15 
 
 		 1171 aa  65.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.4 
 
 		 1057 aa  64.3  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  28.29 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1167 aa  60.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  23.53 
 
 		 922 aa  60.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  26.99 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  27.9 
 
 		 922 aa  60.8  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.28 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  35.11 
 
 		 917 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  24.3 
 
 		 978 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  26.01 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  29.11 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1186 aa  57.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  23.79 
 
 		 901 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  35.94 
 
 		 817 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1210 aa  55.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  34.62 
 
 		 758 aa  55.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  34.62 
 
 		 758 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  29.06 
 
 		 974 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  30 
 
 		 974 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  42.62 
 
 		 729 aa  54.7  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1153 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  32.8 
 
 		 829 aa  54.7  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  29.11 
 
 		 974 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  29.11 
 
 		 974 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1047 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  29.06 
 
 		 767 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  29.06 
 
 		 767 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  42.57 
 
 		 1348 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1277 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  29.75 
 
 		 874 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  25.46 
 
 		 768 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1155 aa  52.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  28.69 
 
 		 974 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1160 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  32.2 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  30 
 
 		 974 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  27.05 
 
 		 719 aa  51.6  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  33.72 
 
 		 895 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.56 
 
 		 924 aa  50.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  22.63 
 
 		 830 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  32.53 
 
 		 912 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 968 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  24.8 
 
 		 880 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  33.88 
 
 		 946 aa  49.7  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  33.71 
 
 		 864 aa  48.9  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  31.46 
 
 		 702 aa  49.3  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1156 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  28.21 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1280 aa  48.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.02 
 
 		 978 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.02 
 
 		 978 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1284 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  31.65 
 
 		 875 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1156 aa  47.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1156 aa  47.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1156 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1181 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1282 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1061 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  32.33 
 
 		 877 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1065 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1149 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  22.51 
 
 		 890 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  42 
 
 		 1152 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.77 
 
 		 812 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  29.17 
 
 		 885 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 		 794 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  24.19 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  24.6 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  27.71 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 814 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 370 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1157 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1414 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  30.46 
 
 		 874 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1180 aa  45.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1127 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  32 
 
 		 878 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  34.67 
 
 		 987 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  28.32 
 
 		 875 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  29.03 
 
 		 1021 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  21.89 
 
 		 979 aa  44.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.27 
 
 		 873 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>