More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0446 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  45.5 
 
 		 723 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.22 
 
 		 697 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  46.02 
 
 		 702 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  56.87 
 
 		 723 aa  845    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  47.12 
 
 		 721 aa  652    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  55.74 
 
 		 727 aa  807    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.12 
 
 		 722 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.52 
 
 		 727 aa  669    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  46.69 
 
 		 714 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  45.8 
 
 		 723 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  47.54 
 
 		 712 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.26 
 
 		 714 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  45.8 
 
 		 713 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  55.74 
 
 		 729 aa  844    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  46.36 
 
 		 695 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  46.65 
 
 		 695 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.11 
 
 		 703 aa  635    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  46.8 
 
 		 718 aa  663    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  48.82 
 
 		 734 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  60.27 
 
 		 728 aa  915    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  64.41 
 
 		 724 aa  972    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 		 695 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  46.97 
 
 		 696 aa  649    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 723 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  48.37 
 
 		 716 aa  669    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.79 
 
 		 695 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.12 
 
 		 714 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  46.8 
 
 		 697 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  72.45 
 
 		 729 aa  1134    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  48.65 
 
 		 699 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.93 
 
 		 695 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  44.63 
 
 		 725 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  58.72 
 
 		 732 aa  876    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 728 aa  1513    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  44.77 
 
 		 725 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  48.16 
 
 		 711 aa  657    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  47.02 
 
 		 697 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  48.23 
 
 		 705 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  48.5 
 
 		 701 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  44.91 
 
 		 733 aa  632  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  45.63 
 
 		 717 aa  634  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  45.9 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 706 aa  631  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 721 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  47.1 
 
 		 697 aa  626  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.92 
 
 		 724 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  43.88 
 
 		 724 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  45.18 
 
 		 723 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  44.38 
 
 		 722 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  44.04 
 
 		 726 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  45.12 
 
 		 727 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  44.46 
 
 		 729 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  44.98 
 
 		 730 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  44.21 
 
 		 726 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  43.24 
 
 		 726 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  42.08 
 
 		 730 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  42.9 
 
 		 702 aa  571  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  40.51 
 
 		 699 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.11 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.04 
 
 		 688 aa  498  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.69 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.5 
 
 		 716 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.65 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  40.23 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  30.77 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  31.25 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  29.35 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  30.72 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  32.28 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  30.07 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  29.3 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  31.78 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  30.07 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  30.86 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  31.54 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  30.07 
 
 		 459 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  30.26 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.08 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  27.86 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  23.92 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  32.68 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  29.56 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  29.3 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  31.01 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  29.03 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  29.86 
 
 		 439 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  30.26 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.68 
 
 		 444 aa  55.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  27.82 
 
 		 449 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.47 
 
 		 450 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  37.8 
 
 		 446 aa  55.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0418  L-glutamine synthetase  26.96 
 
 		 472 aa  54.3  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.69 
 
 		 445 aa  54.3  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  30.89 
 
 		 475 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  27.67 
 
 		 439 aa  54.3  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  35 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  35 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  26.89 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>