253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1491 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  43.57 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  40.17 
 
 		 355 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  40 
 
 		 371 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2734  integrase family protein  30.15 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  29.17 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  34.67 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  35.33 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  29.57 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  28.96 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  24.42 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.57 
 
 		 353 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  31.21 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  26.76 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  29.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.82 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.05 
 
 		 397 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  25 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 391 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.41 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.7 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.45 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  29.94 
 
 		 310 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 395 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.04 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  21.84 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  31.51 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  23.48 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 450 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.06 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.1 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  30.71 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  32.89 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.69 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  32.19 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 400 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  28.3 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  24.1 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.2 
 
 		 388 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.75 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.49 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  31 
 
 		 398 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  31 
 
 		 431 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.56 
 
 		 400 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  31 
 
 		 426 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.22 
 
 		 380 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  31.82 
 
 		 359 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.83 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  30.46 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  29.3 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.73 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.87 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  31.37 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  32.37 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  29.65 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.21 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  28.84 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  29.3 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  28.02 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 450 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.26 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.73 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  30.27 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  25.66 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.68 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  26.02 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  35.56 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 420 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>