118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1364 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  333  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  90.36 
 
 		 166 aa  285  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  86.75 
 
 		 166 aa  280  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.11 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  28.66 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  39.77 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.87 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  40.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  40.91 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.23 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  40.24 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  40.24 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  41.25 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.87 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.85 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  32.41 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30.25 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  40 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  31.79 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.47 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  31.79 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  35.53 
 
 		 406 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.29 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  26.71 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  34.95 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  28.57 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  37.36 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  31.47 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  36.67 
 
 		 414 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  31.37 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  34.18 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  30.67 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  29.38 
 
 		 424 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  29.19 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  32.26 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.73 
 
 		 211 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  32.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 403 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  25.87 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  42.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  29.75 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  28.97 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  28.65 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  28.74 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  38.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  31.45 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  26.29 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  30.49 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 375 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  34.69 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  29.27 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  29.89 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  38.82 
 
 		 375 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.45 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.45 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  26.45 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  28.66 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  30.38 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  27.49 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  27.49 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  25.85 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 424 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  27.49 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  27.49 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 448 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 444 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 449 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  28.05 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  39.24 
 
 		 453 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  34.44 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 398 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  29.66 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  26.94 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  30.41 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>