More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3552 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
970 aa  1986    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.63 
 
 
977 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  52.39 
 
 
998 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 
858 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.5 
 
 
917 aa  482  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.99 
 
 
796 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.39 
 
 
991 aa  465  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.9 
 
 
798 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 
791 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  48.2 
 
 
792 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.2 
 
 
803 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  36.46 
 
 
910 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.13 
 
 
927 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.89 
 
 
984 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
974 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
975 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.54 
 
 
1003 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
1022 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
687 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 
823 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
755 aa  351  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1271 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
1362 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.32 
 
 
1361 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.2 
 
 
1046 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1172 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1155 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1352 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  58.78 
 
 
575 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1917 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1839 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1143 aa  303  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1896 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
929 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1203 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1356 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
2099 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1937 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  33.56 
 
 
1937 aa  291  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.46 
 
 
1196 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1145 aa  290  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.34 
 
 
574 aa  290  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.72 
 
 
1158 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1266 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1237 aa  288  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.42 
 
 
1763 aa  287  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1936 aa  287  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.64 
 
 
1137 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1141 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1195 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1158 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
1771 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
2099 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
2107 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  33.38 
 
 
1695 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
1937 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1159 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
1767 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1137 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1168 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1310 aa  282  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1782 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
1767 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
1767 aa  280  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
944 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1155 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1768 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1267 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1680 aa  277  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1064 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.26 
 
 
923 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
1038 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 
569 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  37.35 
 
 
1765 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1155 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1166 aa  275  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1142 aa  274  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 
2213 aa  274  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  37 
 
 
1214 aa  274  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
1163 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1177 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1216 aa  272  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1713 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1765 aa  271  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.31 
 
 
395 aa  270  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.67 
 
 
777 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1201 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
1784 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  31.08 
 
 
1200 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1954 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  32.53 
 
 
1161 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1158 aa  268  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
1149 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1611 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1782 aa  267  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  30.34 
 
 
1374 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1284 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
912 aa  266  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1792 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
957 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>