More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5693 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  407  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  53.77 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  51.24 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.03 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  36.81 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.8 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  37.17 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.27 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.27 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.27 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.64 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  38.64 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>