More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3183 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
989 aa  1972    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.9 
 
 
995 aa  357  8.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  35.18 
 
 
759 aa  344  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 
856 aa  344  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.52 
 
 
856 aa  339  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.33 
 
 
750 aa  337  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  30.16 
 
 
1029 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  28.77 
 
 
1001 aa  327  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.45 
 
 
977 aa  327  9e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 
761 aa  325  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.08 
 
 
750 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.64 
 
 
735 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.1 
 
 
839 aa  320  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  33.5 
 
 
849 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.27 
 
 
848 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.59 
 
 
991 aa  318  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.25 
 
 
740 aa  318  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.09 
 
 
991 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.23 
 
 
849 aa  317  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.35 
 
 
995 aa  315  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.76 
 
 
762 aa  314  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.15 
 
 
846 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.2 
 
 
996 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 
911 aa  303  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.92 
 
 
990 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.93 
 
 
1055 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.34 
 
 
846 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.06 
 
 
754 aa  298  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.52 
 
 
752 aa  298  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.06 
 
 
754 aa  297  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.9 
 
 
754 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.75 
 
 
754 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.75 
 
 
754 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.9 
 
 
754 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.9 
 
 
754 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.73 
 
 
845 aa  295  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 
755 aa  295  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.07 
 
 
844 aa  294  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.9 
 
 
754 aa  294  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.05 
 
 
748 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.75 
 
 
754 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 
844 aa  292  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.67 
 
 
763 aa  287  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.21 
 
 
759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.21 
 
 
759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.51 
 
 
855 aa  285  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 
853 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.49 
 
 
834 aa  279  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.53 
 
 
844 aa  279  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.9 
 
 
981 aa  277  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 
785 aa  274  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 
785 aa  273  8.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  31.32 
 
 
885 aa  271  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.21 
 
 
759 aa  270  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  33.8 
 
 
793 aa  269  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  32.52 
 
 
843 aa  267  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  36.19 
 
 
487 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.75 
 
 
756 aa  257  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  28.96 
 
 
734 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.72 
 
 
858 aa  240  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.86 
 
 
1400 aa  239  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  31.93 
 
 
470 aa  237  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  31.93 
 
 
470 aa  237  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  32.96 
 
 
495 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.33 
 
 
753 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  37.61 
 
 
414 aa  222  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  31.66 
 
 
495 aa  220  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  33.91 
 
 
457 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 
900 aa  212  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 
533 aa  203  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.32 
 
 
349 aa  202  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 
620 aa  201  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 
533 aa  201  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  39.14 
 
 
471 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.97 
 
 
286 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
532 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  31.15 
 
 
622 aa  199  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.29 
 
 
534 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  30.62 
 
 
605 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.67 
 
 
533 aa  197  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  30.32 
 
 
493 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  39.24 
 
 
489 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  34.69 
 
 
464 aa  197  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.56 
 
 
531 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  38.95 
 
 
489 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 
461 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 
554 aa  195  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 
554 aa  195  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.92 
 
 
554 aa  194  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 
487 aa  193  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  30.75 
 
 
594 aa  193  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  38.49 
 
 
302 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  36.88 
 
 
403 aa  193  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 
301 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.67 
 
 
533 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
533 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.53 
 
 
280 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  30.43 
 
 
525 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  37.85 
 
 
532 aa  191  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  44.01 
 
 
292 aa  190  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>