157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3239 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  43.21 
 
 		 1196 aa  773    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1247 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  49.79 
 
 		 1324 aa  706    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  48.86 
 
 		 1143 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  100 
 
 		 1228 aa  2397    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  47.93 
 
 		 1215 aa  968    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  48.86 
 
 		 1143 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  49.06 
 
 		 1151 aa  946    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1215 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  44.12 
 
 		 1270 aa  780    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  48.85 
 
 		 1143 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  47.3 
 
 		 1163 aa  923    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1139 aa  950    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  49.42 
 
 		 1250 aa  973    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  38.53 
 
 		 1153 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  36.66 
 
 		 1198 aa  546  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  37.64 
 
 		 1082 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1126 aa  462  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1116 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  47.71 
 
 		 1350 aa  456  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1118 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1172 aa  422  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1175 aa  416  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1121 aa  389  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  45.45 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  40.15 
 
 		 1280 aa  352  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.64 
 
 		 1271 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.95 
 
 		 606 aa  111  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.13 
 
 		 986 aa  101  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.33 
 
 		 934 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.06 
 
 		 487 aa  98.2  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.71 
 
 		 902 aa  95.5  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.8 
 
 		 902 aa  94  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1275 aa  90.9  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1259 aa  88.6  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.95 
 
 		 901 aa  87.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.75 
 
 		 1048 aa  85.9  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.97 
 
 		 521 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.62 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.06 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.56 
 
 		 1038 aa  80.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.02 
 
 		 752 aa  80.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.16 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.16 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.74 
 
 		 1255 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.53 
 
 		 2245 aa  78.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.16 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.15 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.62 
 
 		 1653 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  26.92 
 
 		 454 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  27.21 
 
 		 1427 aa  73.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.76 
 
 		 585 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.26 
 
 		 464 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.28 
 
 		 1999 aa  72.8  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  26.13 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.7 
 
 		 1408 aa  71.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.38 
 
 		 1090 aa  71.6  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  21.43 
 
 		 512 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  22.52 
 
 		 486 aa  71.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.45 
 
 		 797 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.63 
 
 		 932 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  25.84 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.29 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  25.84 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.47 
 
 		 1097 aa  69.3  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.42 
 
 		 925 aa  69.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.25 
 
 		 1428 aa  68.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  24.46 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.71 
 
 		 479 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 636 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.26 
 
 		 922 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  42.86 
 
 		 193 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  22.88 
 
 		 1077 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.09 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.12 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.93 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.13 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.86 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25 
 
 		 916 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.26 
 
 		 635 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.12 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.1 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.58 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.7 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.55 
 
 		 1189 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.45 
 
 		 622 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.76 
 
 		 748 aa  63.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.98 
 
 		 1620 aa  63.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  28.88 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  28.88 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  25.61 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.08 
 
 		 928 aa  62.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.59 
 
 		 633 aa  62  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.42 
 
 		 754 aa  60.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.43 
 
 		 1099 aa  60.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.97 
 
 		 715 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  22.87 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  23.03 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  33.53 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>