56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2410 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  69.23 
 
 
494 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  100 
 
 
486 aa  1003    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  53.77 
 
 
512 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  49.42 
 
 
512 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  47.89 
 
 
493 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  47.89 
 
 
493 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  47.65 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  42.65 
 
 
480 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  28.11 
 
 
483 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  27.97 
 
 
502 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  28.37 
 
 
535 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  27.51 
 
 
483 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  24.65 
 
 
490 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  24.84 
 
 
472 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  24.9 
 
 
472 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  24.64 
 
 
472 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  27.38 
 
 
491 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.81 
 
 
1118 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  26.18 
 
 
446 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  31.3 
 
 
396 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26 
 
 
1082 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.93 
 
 
1116 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.64 
 
 
1126 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  27.1 
 
 
390 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  23.61 
 
 
495 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  24.94 
 
 
394 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  24.94 
 
 
394 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  24.74 
 
 
1153 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.41 
 
 
1198 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.09 
 
 
1172 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  26.04 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.95 
 
 
1250 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  24.38 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.24 
 
 
1163 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  24.23 
 
 
1121 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  22.02 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  23.6 
 
 
1151 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.16 
 
 
1280 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.67 
 
 
1139 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  23.78 
 
 
1215 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  24.16 
 
 
1143 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  24.16 
 
 
1143 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.16 
 
 
1143 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.91 
 
 
1270 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  28.02 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.12 
 
 
1228 aa  63.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  25.42 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  22.97 
 
 
1350 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.76 
 
 
1247 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  23.05 
 
 
1196 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.97 
 
 
1324 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  23.98 
 
 
522 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  32.22 
 
 
576 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  25.5 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  32.56 
 
 
479 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2984  hypothetical protein  23.22 
 
 
562 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>